Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms