Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms