Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

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Length 128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afvQ3THW5 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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