Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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RubcnlQ3TD16 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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RubcnlQ3TD16 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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RubcnlQ3TD16 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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RubcnlQ3TD16 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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RubcnlQ3TD16 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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RubcnlQ3TD16 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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RubcnlQ3TD16 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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RubcnlQ3TD16 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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RubcnlQ3TD16 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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RubcnlQ3TD16 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms