Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms