Protein–RNA interactions for Protein: Q149G0

UPF0561 protein C2orf68 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q149G0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q149G0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q149G0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q149G0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q149G0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q149G0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q149G0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q149G0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q149G0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Q149G0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Q149G0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q149G0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q149G0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms