Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Ttc39dQ0VF76 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Ttc39dQ0VF76 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Ttc39dQ0VF76 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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