Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms