Protein–RNA interactions for Protein: Q0VB07

Pglyrp4, Peptidoglycan recognition protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp4Q0VB07 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Pglyrp4Q0VB07 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms