Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms