Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms