Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MestQ07646 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MestQ07646 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MestQ07646 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MestQ07646 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MestQ07646 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MestQ07646 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MestQ07646 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MestQ07646 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MestQ07646 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MestQ07646 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MestQ07646 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
MestQ07646 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms