Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
AmbpQ07456 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms