Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms