Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cntn3Q07409 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms