Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 9930120I10Rik-201ENSMUST00000203027 865 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms