Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Ctsll3-201ENSMUST00000043754 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm7684-201ENSMUST00000211891 829 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Pdcl2-201ENSMUST00000031145 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Olfr1032-203ENSMUST00000111589 1393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm20914-202ENSMUST00000188887 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms