Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox10Q04888 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox10Q04888 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox10Q04888 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox10Q04888 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox10Q04888 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox10Q04888 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox10Q04888 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox10Q04888 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox10Q04888 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox10Q04888 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox10Q04888 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox10Q04888 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox10Q04888 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox10Q04888 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox10Q04888 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox10Q04888 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox10Q04888 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox10Q04888 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox10Q04888 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox10Q04888 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms