Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GscQ02591 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GscQ02591 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GscQ02591 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GscQ02591 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GscQ02591 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GscQ02591 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GscQ02591 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GscQ02591 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GscQ02591 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GscQ02591 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GscQ02591 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GscQ02591 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GscQ02591 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GscQ02591 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GscQ02591 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GscQ02591 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GscQ02591 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GscQ02591 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GscQ02591 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GscQ02591 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GscQ02591 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GscQ02591 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GscQ02591 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GscQ02591 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GscQ02591 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GscQ02591 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GscQ02591 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GscQ02591 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GscQ02591 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GscQ02591 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GscQ02591 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GscQ02591 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GscQ02591 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GscQ02591 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GscQ02591 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GscQ02591 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GscQ02591 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GscQ02591 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GscQ02591 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GscQ02591 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GscQ02591 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GscQ02591 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GscQ02591 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GscQ02591 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GscQ02591 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GscQ02591 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GscQ02591 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GscQ02591 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GscQ02591 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GscQ02591 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GscQ02591 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms