Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RykQ01887 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RykQ01887 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RykQ01887 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
RykQ01887 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
RykQ01887 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
RykQ01887 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RykQ01887 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RykQ01887 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
RykQ01887 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RykQ01887 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RykQ01887 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RykQ01887 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RykQ01887 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RykQ01887 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
RykQ01887 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RykQ01887 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RykQ01887 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RykQ01887 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RykQ01887 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RykQ01887 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RykQ01887 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RykQ01887 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RykQ01887 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RykQ01887 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RykQ01887 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RykQ01887 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RykQ01887 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RykQ01887 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RykQ01887 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RykQ01887 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RykQ01887 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RykQ01887 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RykQ01887 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RykQ01887 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RykQ01887 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RykQ01887 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RykQ01887 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RykQ01887 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RykQ01887 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RykQ01887 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RykQ01887 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RykQ01887 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RykQ01887 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RykQ01887 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RykQ01887 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RykQ01887 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RykQ01887 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RykQ01887 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RykQ01887 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RykQ01887 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RykQ01887 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RykQ01887 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RykQ01887 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms