Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcpQ01853 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcpQ01853 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VcpQ01853 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VcpQ01853 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VcpQ01853 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VcpQ01853 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms