Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms