Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EgfrQ01279 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.3 ms