Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms