Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited1P97769 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited1P97769 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms