Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bop1P97452 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bop1P97452 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bop1P97452 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bop1P97452 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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