Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Taf1bP97358 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Taf1bP97358 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Taf1bP97358 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1bP97358 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1bP97358 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1bP97358 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1bP97358 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1bP97358 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1bP97358 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1bP97358 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1bP97358 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1bP97358 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1bP97358 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1bP97358 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1bP97358 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1bP97358 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1bP97358 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1bP97358 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1bP97358 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1bP97358 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1bP97358 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1bP97358 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1bP97358 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1bP97358 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1bP97358 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1bP97358 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1bP97358 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1bP97358 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Taf1bP97358 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Taf1bP97358 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1bP97358 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Taf1bP97358 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1bP97358 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1bP97358 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1bP97358 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1bP97358 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1bP97358 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1bP97358 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1bP97358 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1bP97358 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1bP97358 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1bP97358 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1bP97358 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1bP97358 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1bP97358 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1bP97358 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1bP97358 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Taf1bP97358 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1bP97358 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1bP97358 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1bP97358 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1bP97358 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1bP97358 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1bP97358 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1bP97358 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1bP97358 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1bP97358 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1bP97358 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1bP97358 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1bP97358 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1bP97358 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1bP97358 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1bP97358 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1bP97358 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1bP97358 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1bP97358 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf1bP97358 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Taf1bP97358 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Taf1bP97358 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf1bP97358 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf1bP97358 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Taf1bP97358 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf1bP97358 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf1bP97358 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf1bP97358 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf1bP97358 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf1bP97358 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf1bP97358 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf1bP97358 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf1bP97358 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf1bP97358 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf1bP97358 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf1bP97358 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf1bP97358 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf1bP97358 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf1bP97358 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf1bP97358 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf1bP97358 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf1bP97358 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf1bP97358 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf1bP97358 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf1bP97358 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf1bP97358 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf1bP97358 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf1bP97358 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf1bP97358 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf1bP97358 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf1bP97358 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf1bP97358 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms