Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Mesp1P97309 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Mesp1P97309 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms