Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Otx1P80205 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx1P80205 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx1P80205 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Otx1P80205 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Otx1P80205 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Otx1P80205 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms