Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CiitaP79621 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CiitaP79621 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CiitaP79621 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CiitaP79621 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CiitaP79621 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CiitaP79621 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CiitaP79621 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CiitaP79621 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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