Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeboxP70368 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeboxP70368 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeboxP70368 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeboxP70368 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SeboxP70368 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeboxP70368 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SeboxP70368 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms