Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cux2P70298 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cux2P70298 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cux2P70298 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cux2P70298 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux2P70298 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux2P70298 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux2P70298 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux2P70298 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux2P70298 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux2P70298 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux2P70298 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux2P70298 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux2P70298 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cux2P70298 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cux2P70298 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms