Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkn1P70268 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms