Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms