Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CgnP59242 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CgnP59242 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CgnP59242 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CgnP59242 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CgnP59242 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CgnP59242 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CgnP59242 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CgnP59242 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CgnP59242 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CgnP59242 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CgnP59242 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CgnP59242 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CgnP59242 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CgnP59242 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CgnP59242 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CgnP59242 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CgnP59242 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CgnP59242 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CgnP59242 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CgnP59242 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CgnP59242 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CgnP59242 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CgnP59242 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CgnP59242 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CgnP59242 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CgnP59242 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CgnP59242 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CgnP59242 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CgnP59242 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CgnP59242 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CgnP59242 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CgnP59242 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CgnP59242 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CgnP59242 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CgnP59242 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CgnP59242 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CgnP59242 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CgnP59242 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CgnP59242 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CgnP59242 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CgnP59242 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CgnP59242 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CgnP59242 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CgnP59242 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CgnP59242 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CgnP59242 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CgnP59242 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CgnP59242 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CgnP59242 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CgnP59242 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CgnP59242 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CgnP59242 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CgnP59242 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CgnP59242 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CgnP59242 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CgnP59242 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CgnP59242 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CgnP59242 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CgnP59242 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CgnP59242 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CgnP59242 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CgnP59242 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CgnP59242 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CgnP59242 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CgnP59242 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CgnP59242 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CgnP59242 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CgnP59242 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CgnP59242 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CgnP59242 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CgnP59242 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CgnP59242 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CgnP59242 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CgnP59242 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CgnP59242 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CgnP59242 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CgnP59242 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CgnP59242 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CgnP59242 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CgnP59242 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CgnP59242 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CgnP59242 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CgnP59242 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CgnP59242 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CgnP59242 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CgnP59242 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CgnP59242 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CgnP59242 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CgnP59242 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CgnP59242 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CgnP59242 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CgnP59242 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CgnP59242 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CgnP59242 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CgnP59242 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CgnP59242 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CgnP59242 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CgnP59242 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CgnP59242 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms