Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms