Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tpm2P58774 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms