Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms