Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace1P56818 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace1P56818 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace1P56818 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms