Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb4P54761 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb4P54761 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb4P54761 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ephb4P54761 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ephb4P54761 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ephb4P54761 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ephb4P54761 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ephb4P54761 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ephb4P54761 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ephb4P54761 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ephb4P54761 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb4P54761 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb4P54761 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb4P54761 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ephb4P54761 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ephb4P54761 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb4P54761 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb4P54761 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ephb4P54761 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb4P54761 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ephb4P54761 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb4P54761 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb4P54761 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb4P54761 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb4P54761 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb4P54761 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb4P54761 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb4P54761 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb4P54761 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb4P54761 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb4P54761 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb4P54761 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb4P54761 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb4P54761 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb4P54761 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb4P54761 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb4P54761 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb4P54761 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb4P54761 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb4P54761 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb4P54761 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb4P54761 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb4P54761 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb4P54761 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb4P54761 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb4P54761 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb4P54761 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb4P54761 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb4P54761 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb4P54761 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb4P54761 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb4P54761 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb4P54761 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb4P54761 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb4P54761 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb4P54761 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb4P54761 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb4P54761 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ephb4P54761 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ephb4P54761 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb4P54761 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb4P54761 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms