Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms