Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbrP50284 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbrP50284 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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LtbrP50284 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbrP50284 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms