Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxcl5P50228 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms