Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod1P49813 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod1P49813 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod1P49813 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod1P49813 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod1P49813 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmod1P49813 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmod1P49813 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod1P49813 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod1P49813 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod1P49813 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod1P49813 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod1P49813 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod1P49813 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod1P49813 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod1P49813 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod1P49813 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod1P49813 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod1P49813 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod1P49813 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod1P49813 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod1P49813 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod1P49813 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod1P49813 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmod1P49813 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmod1P49813 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmod1P49813 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmod1P49813 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmod1P49813 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod1P49813 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmod1P49813 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod1P49813 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmod1P49813 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod1P49813 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod1P49813 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod1P49813 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmod1P49813 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod1P49813 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod1P49813 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod1P49813 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmod1P49813 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod1P49813 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod1P49813 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmod1P49813 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod1P49813 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod1P49813 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmod1P49813 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod1P49813 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod1P49813 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod1P49813 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod1P49813 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod1P49813 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod1P49813 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod1P49813 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod1P49813 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod1P49813 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod1P49813 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod1P49813 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmod1P49813 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmod1P49813 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmod1P49813 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmod1P49813 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmod1P49813 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms