Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfbP49766 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfbP49766 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfbP49766 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfbP49766 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfbP49766 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfbP49766 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VegfbP49766 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfbP49766 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfbP49766 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfbP49766 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfbP49766 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfbP49766 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfbP49766 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfbP49766 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfbP49766 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfbP49766 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfbP49766 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VegfbP49766 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfbP49766 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VegfbP49766 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfbP49766 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VegfbP49766 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfbP49766 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfbP49766 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VegfbP49766 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VegfbP49766 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VegfbP49766 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VegfbP49766 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VegfbP49766 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VegfbP49766 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfbP49766 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfbP49766 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfbP49766 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfbP49766 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfbP49766 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfbP49766 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfbP49766 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfbP49766 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VegfbP49766 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfbP49766 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfbP49766 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfbP49766 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VegfbP49766 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VegfbP49766 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VegfbP49766 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VegfbP49766 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VegfbP49766 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VegfbP49766 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VegfbP49766 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VegfbP49766 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VegfbP49766 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VegfbP49766 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VegfbP49766 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VegfbP49766 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VegfbP49766 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VegfbP49766 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VegfbP49766 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VegfbP49766 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VegfbP49766 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms