Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc3P49135 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms