Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gli1P47806 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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