Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SrprbP47758 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrprbP47758 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrprbP47758 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SrprbP47758 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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SrprbP47758 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrprbP47758 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrprbP47758 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SrprbP47758 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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