Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Tnfsf9P41274 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms