Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Grik2P39087 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik2P39087 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik2P39087 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik2P39087 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik2P39087 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms